蛋白质组学研究对样本前处理的通量、稳定性和重复性提出了越来越高的要求。传统人工移液操作步骤繁琐，易受人为因素影响，在大批量样本处理中存在效率低、操作一致性不足及批间差异等问题。全自动移液工作站通过程序化控制液体转移、试剂添加、混匀、孵育及样本分装等关键步骤，可实现蛋白质谱前处理流程的自动化与标准化。本报告将围绕全自动移液工作站在蛋白质组学样本前处理中的应用，介绍其在蛋白提取、还原烷基化、酶解、脱盐及肽段纯化等环节中的自动化实现，并结合实际应用探讨其对样本处理通量、操作一致性和实验重复性的提升。通过自动化流程的建立，可有效降低人工操作误差，提升复杂蛋白质组学实验的标准化水平，为高通量、规模化蛋白质组学研究提供可靠的技术支撑。