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菌种鉴定及分析
菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，然后PCR扩增16srDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌（当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标）。通过菌种基因测序，分析菌种基因片段，判断菌种种是否含有抗药性基因等。
检测项目
鉴定方法 | 涉及菌种 |
rDNA（核糖体DNA）序列分析 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
大型丝状真菌 | |
功能基因分析 | 乳杆菌、双歧杆菌、肠球菌 |
pheS,gyrB,gyrA,atpD等 | 芽孢杆菌 |
生理生化分析 | 细菌、放线菌、酵母 |
BioLog分析 | 细菌、酵母 |
API | 细菌、酿酒酵母 |
形态学分析 | 霉菌 |
1、2分别与3、4、5组合 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
大型丝状真菌 | |
G+C mol%含量测定 | 细菌、放线菌、酵母 |
脂肪酸组分分析 | 细菌、放线菌、酵母 |
DNA-DNA杂交 | 细菌、放线菌、酵母 |
极性脂 | 细菌、放线菌 |
呼吸醌 | 细菌、放线菌 |
电子显微镜 | 细菌、放线菌、酵母、霉菌 |
