多糖（polysaccharide）的化学结构是其生物活性的基础，结构的变化会影响其生物活性。由于是复杂的生物大分子，其结构的复杂性给多糖解析过程带来了很大困难。多糖结构解析的手段很多，包括红外、核磁共振、质谱等仪器分析法，还有酸水解、甲基化反应等化学方法，以及糖苷酶酶切、免疫学分析等生物学方法。

甲基化分析是多糖和寡糖结构分析最有力的手段之一，可以得到部分甲基化的糖醇乙酰衍生物，借助气相色谱-质谱联合分析 (GC-MS)进行定性和定量分析，从而确定各单糖残基的连接方式。

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