致病菌(Pathogenic bacteria ) 是能引起疾病的微生物，也被称为病原微生物，其包括细菌、病毒、螺旋体、立克次氏体、衣原体、支原体、真菌及放线菌等。

病原微生物包括细菌、病毒、螺旋体、立克次氏体、衣原体、支原体、真菌及放线菌等。一般所说的致病菌指的是病原微生物中的细菌。

细菌的致病性与其毒力、侵入数量及侵入门户有关。虽然绝大多数细菌是无害甚至有益的，但是相当大一部分可以致病。

条件致病菌只在特定条件下致病，如有伤口可以允许细菌进入血液，或者免疫力降低时。 例如，金黄色葡萄球菌和链球菌也是正常菌群，常可以存在于体表皮肤，鼻腔而不引起疾病，但可以潜在引起皮肤感染，肺炎(pneumonia)，脑膜炎(meningitis)败血症(sepsis)。

关于食品致病菌限量的标准主要有：GB 29921-2013 食品安全国家标准 食品中致病菌限量。